載體指南
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第一次使用顯微注射法將DNA遞送至線蟲體內(nèi)的實(shí)驗(yàn)發(fā)生在1991年。在這個(gè)實(shí)驗(yàn)中,常規(guī)質(zhì)粒DNA被注射到線蟲的遠(yuǎn)端性腺。注射后的DNA進(jìn)入性腺細(xì)胞細(xì)胞核中形成染色體以外的質(zhì)粒微陣列,并可以遺傳到下一代。該種技術(shù)存在多種局限:首先,常規(guī)質(zhì)粒形成的微陣列在多個(gè)世代后其表達(dá)水平可能會(huì)不穩(wěn)定。第二,該方式產(chǎn)生的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物是嵌合體,意味著有一些細(xì)胞成功轉(zhuǎn)染了而另一些則沒(méi)有。
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參考文獻(xiàn) | 主題 |
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EMBO J. 10:3959 (1991) | DNA transformation in C. elegans |
Sci Rep. 9:9192 (2019) | Promoter-proximal introns increases gene expression levels in C. elegans. |
我們的載體經(jīng)過(guò)專門優(yōu)化,整合了啟動(dòng)子近端的內(nèi)含子序列在載體骨架上,可以在線蟲中高水平表達(dá)目的基因。
技術(shù)簡(jiǎn)單:向線蟲轉(zhuǎn)染質(zhì)粒載體是技術(shù)上相對(duì)直接且對(duì)比病毒載體需要包裝生產(chǎn)而更為簡(jiǎn)單的方式??梢允褂秒娹D(zhuǎn)染、顯微注射或者喂食包含質(zhì)粒載體的大腸桿菌等方式將質(zhì)粒導(dǎo)入線蟲體內(nèi)。
裝載量大:我們的載體可以容納總共約30 kb的DNA。該質(zhì)粒的骨架部分只占約2.25 kb,因此留下了巨大的空間用于插入用戶的目的基因。
高表達(dá)水平:合成的啟動(dòng)子近端的內(nèi)含子序列被整合至載體骨架,可以帶來(lái)很高水平的基因表達(dá)。
載體DNA無(wú)法整合基因組:常規(guī)質(zhì)粒載體主要以游離體DNA的形式存在于細(xì)胞中而且通常不整合基因組。如果質(zhì)粒載體含有抗藥性基因的表達(dá)盒,那么載體DNA穩(wěn)定整合細(xì)胞基因組可以對(duì)轉(zhuǎn)染的細(xì)胞進(jìn)行藥篩。
可轉(zhuǎn)染的細(xì)胞類型有限:使用常規(guī)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染不同的細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)染效率差異可能很大。
基因遞送效果的不均一性:盡管高水平表達(dá)的轉(zhuǎn)基因容易實(shí)現(xiàn),但是質(zhì)粒轉(zhuǎn)染的均一性可能較差。有些細(xì)胞攜帶較多的質(zhì)??截?,有些則攜帶較少的拷貝甚至沒(méi)有。
Promoter: The promoter driving your gene of interest is placed here.
Synthetic intron: This is placed in proximal to promoter to promote gene expression.
Kozak: Kozak consensus sequence. This is placed in front of the start codon of the ORF of interest to facilitate translation initiation in eukaryotes.
ORF: The open reading frame of your gene of interest is placed here.
3' UTR+polyA: Allows transcription termination and polyadenylation of mRNA transcribed by RNA polymerase II. It functions in somatic and germ cells.
Ampicillin: Ampicillin resistance gene. It allows the plasmid to be maintained by ampicillin selection in E. coli.
pUC ori: pUC origin of replication. Plasmids carrying this origin exist in high copy numbers in E. coli.